Éditorial

De nombreux projets émergent autour de la modélisation en situtation de crise sanitaire. Beaucoup d’entre vous nous ont informé de leurs projets. N’hésitez pas à nous faire part de l’évolution de ces projets, du démarrage de nouveaux projets. Vous pouvez pour cela nous écrire à l'adresse contact en indiquant la chaîne [projet] en objet du mail.

Vos projets peuvent être aussi indiqués dans le formulaire en ligne. Pour accéder à la possibilité de décrire le projet, il convient de répondre « J’ai une expertise en modélisation en épidémiologie » à la question « Expertise en modélisation utilisable en crise épidémiologique ». Les réponses au questionnaire peuvent être modifiées en se reconnectant avec le lien qui vous a été envoyé pour la première connexion.

Offres d’emploi

Deux postes post-doctoraux de 18 mois

Deux postes post-doctoraux de 18 mois en modélisation mathématique des maladies infectieuses sont disponibles pour travailler à l’Institut Pasteur et au Conservatoire national des arts et métiers de Paris. Les titulaires de poste travailleront sur la modélisation mathématique de la transmission de Covid-19 dans les établissements de santé et développeront des modèles, analyseront les données hospitalières et réaliseront des études de simulation pour évaluer l’impact des mesures de contrôle. Les candidates et candidats doivent avoir un doctorat en épidémiologie des maladies infectieuses, en modélisation mathématique ou en biologie computationnelle. Elles et ils doivent avoir une solide expérience en programmation informatique, modélisation et statistiques, et d’excellentes compétences en communication. Une expérience de l’épidémiologie des maladies infectieuses ou de la recherche liée aux soins de santé serait un avantage. Les candidates et candidats intéressés doivent envoyer leur candidature (CV comprenant la liste des publications, lettre de motivation et noms de deux arbitres) à Lulla Opatowski et Laura Temime. Les candidatures seront évaluées en continu jusqu’à ce que les deux postes soient pourvus.

Événements, conférences à distance

Modeling and Control of the Covid-19 Outbreak, Italian Chapter of the IEEE Control Systems Society

L’atelier aura lieu le vendredi 24 avril de 9h30 à 17h20 (UTC+2) et il sera entièrement en anglais. Les vidéos resteront disponibles après l’événement.

Informations

GdT Maths4covid19

Depuis le jeudi 12 mars 2020, un groupe de travail (virtuel) de mathématiciennes et mathématiciens appliqués s’est constitué pour évaluer les modèles qui ont été développés, notamment au LJLL et au LPSM, pour appréhender le problème Covid-19 à toutes ses échelles, allant du comportement moléculaire au niveau de la progression mondiale. Les exposés sont disponibles sur le site dédié.

Canadian Covid-19 Math Modelling Task Force Distinguished Lecture Series

Une visioconférence de Pierre Magal organisée par l’Institut Fields disponible sur le site de l’Institut Fields

Bibliographie

Outil de visualisation des preprints disponibles

Interface de recherche et parcours du corpus de littérature scientifique concernant la pandémie de Covid-19.

https://covid19preprints.app

Outil de veille bibliographique

Projet de veille et d’analyse bibliographique porté par des médecins du CHU de Grenoble.

https://bibliovid.org

Une page de ressources au Centre Borelli

La page Covid-19 epidemic

Une page de ressources à l’IMT

Sur la page de Patrick Cattiaux

Sources de données

Retrouvez les sources précédemment publiées sur la page dédiée de notre site.

HealthDataHub

Les données de santé financées par la solidarité nationale constituent un patrimoine commun. La mission du Health Data Hub est de les mettre au service du plus grand nombre dans le respect de l’éthique et des droits fondamentaux des citoyens, grâce à un accès aisé et unifié, transparent et sécurisé. Ne pas hésiter à nous contacter pour des demandes spécifiques.

Patient medical data for novel coronavirus Covid-19

  • Source (mise en ligne le 13/04) : Epidemiological data from the 2019 nCoV outbreak, mise en forme par Wolfram.
  • Description : dossiers médicaux des patients infectés par le nouveau coronavirus Covid-19. Dossier du patient, y compris l’âge, le sexe, le lieu, la date d’apparition, les symptômes, les antécédents de voyage, les maladies chroniques et la date de sortie ou de décès

Patient medical data for novel coronavirus Covid-19

Veille CEBM

Veille CEBM

Covid Tracking Project

À l’échelle des états américains, nombres de personnes testées positives ou négatives, nombres de personnes hospitalisées en réanimation, sous assistance respiratoire, nombres de guérisons et de décès (description détaillée).

Covid Tracking Project

###Génome

The European Covid-19 Data Portal

  • Source : The European Commission and EMBL’s European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), together with EU Member States.
  • Description (extraite du site le 20/04) : le portail européen de données Covid-19 rassemblera et mettra à jour en continu les ensembles de données et outils Covid-19 pertinents, hébergera le partage de données de séquence et facilitera l’accès à d’autres ressources SARS-CoV-2.

The European Covid-19 Data Portal

Genetic and Protein Sequences for the SARS-CoV-2 Coronavirus

CDC Primers for SARS-CoV-2 Research

  • Source : données issues du US Centers for Disease Control and Prevention (CDC) et mises en forme pour le calcul ;
  • Description : amorces fournies par les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis pour identifier le SARS-CoV-2 à des fins de recherche, y compris les noms, les séquences, la concentration de travail et les informations connexes.

CDC Primers for SARS-CoV-2 Research

Sondages en cours

Baromètre Covid-19, projet de science citoyenne

Au moins 6 à 8 vagues hebdomadaires de 5 000 répondants par une enquête en ligne opérée par IPSOS. Descriptif

Transmettre des informations

Les propositions d’informations pour cette lettre peuvent être transmises à l'adresse contact par un message dont l’objet contient la chaîne [lettre]. Proposer n’implique pas être publié, être publié n’implique pas recevoir caution scientifique.

Gérer son abonnement à la liste, son affichage sur le site

Vous avez souhaité être membre de la plateforme d’expertes et experts en modélisation autour de Covid-19. À ce titre, vous êtes inscrit ou inscrite à la liste de diffusion de cette lettre.

Pour vous désabonner, envoyez un message à sympa@listes.math.cnrs.fr ayant pour objet unsubscribe modelisation_covid. L’adresse d’expédition doit être l’adresse à désabonner.

La page des membres du site recense les compétences et projets de ses membres. Pour apparaître dans ce recensement :

  • Connectez-vous sur le site d’invitation ;
  • Entrez une adresse mail ;
  • Vous recevrez à cette adresse un mail de Plateforme MODCOV19 covid@math.cnrs.fr ;
  • Ce mail contient une invitation sous forme de lien, appelé « lien d’invitation » ;
  • Suivez ce lien d’invitation et répondez au questionnaire.

Grâce au lien, vous pouvez modifier les données entrées en reprenant le questionnaire.

Si vous souhaitez que vos données soient effacées, merci de nous en informer en écrivant à l'adresse contact un message dont l’objet la chaîne de caractères [web].