Vous retrouverez cette lettre ainsi que les précédentes sur le site de MODCOV19.


Éditorial

MODCOV19 continue ses activités : vous trouverez dans cette lettre des informations sur les prochains groupes de travail (pour le moment toujours sur une base bimensuelle), les derniers articles mis en ligne dans le cadre de la veille bibliographique (à laquelle nous vous invitons toujours à participer). Nous vous rappelons aussi qu’il est encore possible d’envoyer des propositions de projets (clôture de l’appel ce soir à minuit). Continuez enfin à nous informer de vos (pré)publications (détails de la procédure et travaux signalés sur https://modcov19.math.cnrs.fr/prepublications/).
Cette lettre contient aussi des annonces transmises par les membres de MODCOV19, dont notamment une offre d’emploi de Data Analyst à Santé Publique France.


Prochaines séances du Groupe de Travail

Les prochaines séances du groupe de travail auront lieu les 3 et 17 novembre 2020, de 14h à 16h.

Mardi 3 novembre, Modèles intra-hôtes

14h - 14h30 : Modeling SARS-Cov-2 viral dynamics to optimize antiviral therapy, Jérémie Guedj (INSERM, Infection . Antimicrobials . Modelling . Evolution – Paris)

14h30 - 15h00 : titre provisoire: T cell memory formation after mild COVID-19 infection, Aleksandra Walczak (Laboratoire de Physique, Ecole Normale Supérieure – Paris)

15h00 - 15h30 : Evaluating the longevity of humoral response: from Ebola to COVID-19, Mélanie Prague (INRIA, Statistiques pour la médecine translationnelle – SISTM, Bordeaux)

15h30 - 16h00 : Discussion générale.

(plus de détails sur la page dédiée)

Mardi 17 novembre, Un regard économique sur la pandémie et sa gestion

NB: l’ordre des interventions est susceptible de changer

14h - 14h30 : Choisir des stratégies de lutte contre le covid19 en tenant compte de leur acceptabilité par la population – premiers résultats du projet CONFINOBS, Bruno Ventelou (CNRS, Aix-Marseille Sciences Economiques, Aix-Marseille Université)

14h30 - 15h00 : Ethique du confinement, Marc Fleurbaey (CNRS, Paris School of Economics PSE)

15h00 - 15h30 : Inégalité de santé et d’accès aux soins pendant la pandémie., Florence Jusot (Université Paris-Dauphine, PSL Research University, Leda-Legos)

15h30 - 16h00 : Discussion générale.

(plus de détails sur la page dédiée)

Veille bibliographique

Fiches réalisées par des membres de MODCOV19

43 fiches bibliographiques sont disponibles sur le site de MODCOV19. Nous avons toujours besoin de votre aide pour continuer ce travail. Vous trouverez les détails utiles en haut de la page de la veille bibliographique.

Fiches réalisées ce mois :

  • Borremans, B., Gamble, A., Prager, K. C., Helman, S. K., McClain, A. M., Cox, C., … & Lloyd-Smith, J. O. (2020). Quantifying antibody kinetics and RNA detection during early-phase SARS-CoV-2 infection by time since symptom onset. Elife, 9, e60122. (lien)

  • Foutel-Rodier, F., Blanquart, F., Courau, P., Czuppon, P., Duchamps, J. J., Gamblin, J., … & Schertzer, E. (2020). From individual-based epidemic models to McKendrick-von Foerster PDEs: A guide to modeling and inferring COVID-19 dynamics. arXiv preprint arXiv:2007.09622. (lien)

  • Rasigade, J. P., Barray, A., Shapiro, J. T., Coquisart, C., Vigouroux, Y., Bal, A., … & Wirth, T. (2020). SARS-CoV-2 phylodynamics differentiates the effectiveness of non-pharmaceutical interventions. medRxiv. (lien)

  • Richard, Q., Alizon, S., Choisy, M., Sofonea, M. T., & Djidjou-Demasse, R. (2020). Age-structured non-pharmaceutical interventions for optimal control of COVID-19 epidemic. medRxiv. (lien)

Autres ressources de veille bibliographique

COREB-REACTing met à disposition un riche diaporama présentant les dernières avancées dans la recherche scientifique sur la Covid19
https://reacting.inserm.fr/other-resources/

Rappel : Financement de projets

Les propositions de projets peuvent être envoyées jusqu'à ce soir (30/10) minuit.

De nombreux projets en modélisation ont émergé durant la crise de la Covid-19 et grâce à la mobilisation de la communauté, MODCOV19 a pu suivre l’évolution d’une grande partie d’entre eux. Beaucoup sont directement liés à la compréhension de la dynamique de l’épidémie, mais l’apport de la modélisation va bien plus loin : modélisation biophysique des modes de transmission du virus, modèles intra-hôte, évolution génétique, outils d’aide au diagnostic ou à l’organisation et l’optimisation des ressources des services médicaux, diffusion des comportements ou des pratiques, …

Afin de continuer à soutenir cet effort de modélisation multi-disciplinaire en réponse à la crise, la plateforme MODCOV19 est susceptible de financer plusieurs projets d’au plus 3000€(déplacements, rencontres, gratifications de stage, …) portant sur l’un des nombreux aspects de la gestion de la crise sanitaire de la Covid-19(*). Priorité sera donnée aux projets portés par un groupe de chercheurs ou chercheuses interdisciplinaire et aux projets comportant un volet de vulgarisation scientifique.

Pour postuler, un document de 1 à 3 pages présentant la proposition de projet doit être envoyé à covid@math.cnrs.fr avant le 30/10/2020 à minuit, en insérant la chaîne de caractères [appel] dans l’objet du mail. Le document devra décrire le positionnement du sujet dans la littérature actuelle, ainsi que la nouveauté de l’approche et l’apport spécifique du projet par rapport à l’existant.

L’évaluation des projets s’appuiera sur la grille de lecture suivante.

  1. Adéquation, originalité, pertinence.
  2. Méthodologie et faisabilité.
  3. Qualité du demandeur ou de la demandeuse, et des équipes impliquées.
  4. Évaluation de la demande budgétaire et de la durée.
  5. Évaluation éthique (si nécessaire).

Bien cordialement, L'équipe de coordination de MODCOV19

(*) Voir par exemple la liste non-exhaustive https://modcov19.math.cnrs.fr/themes/

Données

Annonces

Offre d’emploi de Data Analyst à Santé Publique France

Santé publique France recherche un·e excellent·e spécialiste des données pour travailler sur les tests de laboratoire COVID-19 (SIDEP).
Détails du poste sur https://www.santepubliquefrance.fr/offres-d-emploi/charge-d-etude-scientifique2

Conférences en ligne

Sortie de livre

“La diffusion de la Covid-19
Que peuvent les modèles ?”
par Juliette Rouchier, Victorien Barbet
Éditions Matériologiques
https://materiologiques.com/fr/modelisations-simulations-systemes-complexes-2425-5661/312-la-diffusion-de-la-covid-19-que-peuvent-les-modeles--9782373612561.html

Extrait du résumé donné par la maison d’édition
Face à l’irruption de la Covid-19, ont surgi des demandes urgentes de prédire, d’expliquer et de faire comprendre sa diffusion, notamment lorsqu’il s’agissait de soutenir telle ou telle décision politique ou de santé publique (distanciations, confinement, etc.). Plusieurs modèles computationnels – en particulier à agents – ont été bien vite mis en avant. Mais dans quelle mesure sont-ils réellement à même de remplir de telles fonctions, en particulier dans un contexte où les données pertinentes sont presque inexistantes ?
L’ouvrage comprend deux parties : l’une qui propose une analyse critique de modèles existants, l’autre prenant la forme de trois propositions de modèles qui permettent de percevoir la richesse potentielle et la multiplicité de point de vue des modèles agents de diffusion de maladie – à la fois dans leur conception et leur manipulation. Un glossaire et un intermède sur les « apports des modèles agents en général et pour la Covid-19 en particulier » replacent ces réflexions dans le cadre plus large de la simulation agents appliquée aux sciences sociales.
Ce livre […] s’adresse à un large lectorat. […]

Interviews de membres de MODCOV19

Transmettre des informations

Les propositions d’annonces pour cette lettre peuvent être transmises à l’adresse contact par un message dont l’objet contient [lettre]. Proposer n’implique pas être publié, être publié n’implique pas recevoir caution scientifique.