Multilocus adaptation to vaccination

MCLEOD David V. (Bern University, Switzerland), GANDON Sylvain (CEFE, CNRS)

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.06.01.446592v1

L’adaptation des pathogènes aux vaccins peut impliquer de nombreuses mutations et affecter des traits phénotypiques différents. En particulier, l’adaptation peut affecter l’échappement à l’immunité ou à la virulence. Nous développons ici un modèle qui s’intéresse à la dynamique multilocus du virus permettant de prendre en compte l’influence de la recombinaison et de l’épistasie sur la dynamique de l’adaptation. Nous montrons aussi comment différents types de vaccins peuvent affecter la dynamique de l’adaptation virale.