On the evolutionary epidemiology of SARS-CoV-2

DAY Troy (Queen’s University, Canada), GANDON Sylvain (CEFE, CNRS), LION Sébastien (CEFE, CNRS), OTTO Sally (University of British Columbia, Canada)

https://doi.org/10.1016/j.cub.2020.06.031

Cet article fait le point sur le potentiel évolutif du SARS-CoV-2 au tout début de la pandémie. Nous développons un modèle prenant en compte à la fois la dynamique épidémiologique et la dynamique évolutive du virus. Nous utilisons ce modèle pour explorer différents scénarios décrivant l’invasion de nouveaux variants ayant des caractéristiques phénotypiques leur permettant de se propager rapidement dans la population. Nous explorons en particulier l’influence des stratégies de contrôle non pharmaceutique sur la vitesse de propagation de ces différents variants.

Day, T., Gandon, S., Lion, S., & Otto, S. P. (2020). On the evolutionary epidemiology of SARS-CoV-2. Current Biology, 30(15), R849-R857.